5-Nitro-2-Tiyofen-Karboksialdehit İçereren Kristal Yapıların X-Işını Kırınımı ve Hesaplamalı Yöntemlerle Aydınlatılması

Abstract

Bu çalışmada 5-nitro-2-tiyofen-karboksialdehit türevi gruplar içeren bazı bileşiklerin kristal yapıları tek kristal X-ışını kırınımı yöntemiyle aydınlatıldı. Kapalı formülleri, C19H19N3O3 (I), C11H7ClN2O2S (II), C13H12N2O3S (III), C12H7F3N2O2S (IV), C12H9N3O4S (V) şeklinde olan kristaller Ondokuz Mayıs Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Kimya Bölümü Organik Kimya Laboratuarında sentezlendi. Kristal verileri Ondokuz Mayıs Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Fizik Bölümü Kristalografi Laboratuarında STOE IPDS II difraktometresinde toplandı. Kristal yapılar SHELXS-97 programı kullanılarak direkt yöntemler yardımı ile çözüldü ve SHELXL-97 programı kullanılarak en küçük kareler yöntemi ile arıtıldı. Daha sonra, Gaussian 03W programı kullanılarak, HF, YFT/B3LYP ve PM3 yöntemleriyle geometrik optimizasyon yapıldı. Kristal yapıların geometrik parametreleri ve optimize yapılara ait titreşim frekansları teorik olarak elde edildi ve deneysel sonuçlarla karşılaştırıldı.

In this study, crystal structures of some compounds containing 5-nitro-2-thiophene-carboxyaldehyde derivative have been determined by X-ray diffraction method. The crystals of C19H19N3O3 (I), C11H7ClN2O2S (II), C13H12N2O3S (III), C12H7F3N2O2S (IV), C12H9N3O4S (V) were synthesized in Organic Chemistry Laboratory of Chemistry Department in Ondokuz Mayıs University. Crystal data were collected on a STOE IPDS II diffractometer in Crystallography Laborator of Physics Department in Ondokuz Mayıs University. Crystal structures have been solved by direct methods with the program SHELXS-97 and refined by using least squares refinement with the program SHELXL-97. Then, with Gaussian 03W software, geometric optimization was performed by HF, YFT/B3LYP and PM3 methods. Geometric parameters of crystal structures and vibrational frequencies for optimized molecular structures have been obtained theoretically and compared with X-ray results.