Publication:
Mastitis İzolatı Stafilokok Suşlarında Vankomisin Dirençliliğinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Araştırılması

dc.contributor.advisorÇiftci, Alper
dc.contributor.authorGökdağ, Mehmet Onur
dc.date.accessioned2020-07-21T22:03:47Z
dc.date.available2020-07-21T22:03:47Z
dc.date.issued2017
dc.departmentOMÜ, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Veterinerlik Mikrobiyolojisi Anabilim Dalıen_US
dc.departmentSağlık Bilimleri Enstitüsü / Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
dc.descriptionTez (yüksek lisans) -- Ondokuz Mayıs Üniversitesi, 2017en_US
dc.descriptionLibra Kayıt No: 116575en_US
dc.description.abstractAmaç: Bu çalışmada mastitis izolatı stafilokok suşlarında vankomisin dirençliliğinin, diğer bazı antibiyotiklere dirençliliğinin ve bazı virülens faktörlerinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve metot: Çalışma kapsamında 100 adet stafilokok izolatı incelendi. İzolatlar PCR ile identifiye edildi. Tüm izolatların okzasilin, vankomisin, teikoplanin, trimetoprim-sulfometaksazol, tetrasiklin, penisilin G, sefaperazon ve amoksisilin-klavulonik asite karşı antibiyotik dirençlilikleri Kirby bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlendi. Vankomisin dirençli izolatların Minimal İnhibe Edici Konsantrasyonları (MİK)'nın belirlenmesi broth mikro dilüsyon tekniği ile gerçekleştirildi. Vankomisin direnç genotipleri PCR ile belirlendi. Vankomisin dirençli izolatların filogenetik yakınlıkları RAPD-PCR ile araştırıldı. Staphylococcus aureus izolatlarında virülenste rol oynadığı bilinen coa ve spa genlerinin polimorfizmleri PCR ile araştırıldı. Bulgular: İzolatların 73 adeti S. aureus ve 27 adedi de Staphylococcus spp. olarak identifiye edildi. İzolatların 9, 5, 5, 7, 6, 4, 11 ve 17 adedi sırasıyla 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 ve 1 antibiyotiğe karşı dirençli olduğu belirlendi. Otuzaltı adet izolatın tüm antibiyotiklere duyarlı olduğu saptandı. Staphylococcus spp. izolatlarında vankomisin direnci bulunmazken, 9 adet S.aureus izolatında vankomisin direnci belirlendi. Vankomisin dirençli izolatların 2 adetinin 64 μg/ml ve 7 adetinin de 32 μg/ml oranında vankomisine dirençli olduğu saptandı. İki adet izolatın vanA ve 3 adetinin de vanR genini içerdikleri saptandı. Dört adet izolatta ise incelenen direnç genleri belirlenemedi. Vankomisin dirençli suşların %51-75 oranında benzerlik gösteren 9 adet tekli genotip gösterdikleri belirlendi. S. aureus izolatlarından 48 adeti 9 farklı profilde coa polimorfizmi gösterdi. Otuzbeş izolatın ise coa geni içermediği belirlendi. İncelenen 73 adet izolatın spa geni içerdiği ve 4 farklı profilde oldukları saptandı. Sonuç: Mastitis kökenli stafilokok suşlarında vankomisin direncinin belirlendi ve bu suşları içeren sütlerin ve süt ürünlerinin halk sağlığı yönünden bir risk teşkil ettiği kanısına varıldı.
dc.description.abstractAim: This study was aimed to determine the vancomycin resistances, antibacterial resistance profiles and some virulence genes pheno- and genotypically among staphylococci from mastitis. Material ve methods: A total of 100 staphylococal isolates which are available in our culture collection were investigated. The isolates were identified by PCR. The antibacterial resistances of the isolates against oxacillin, vancomycin, teicoplanine, trimetophrim-sulfometaxazole, tetracycline, penicilline G, cefaperazone and amoxicillin-clavulanic acide were determined by Kirby Bauer disc diffusion method. The Minimal Inhibitory Concentration (MIC) of vancomycin for phenotypically vancomycin resistant isolates were investigated by broth micro dilution technique. The vancomycin resistance genotypes were determined by PCR. The phylogenetic relation among vancomycin resistant isolates were determined by RAPD-PCR. coa and spa polymorphisms of Staphylococcus aureus isolates were determined by PCR. Results: Seventy-three and 27 of the isolates were identified as S.aureus and Staphylococcus spp., respectively. The 9, 5, 5, 7, 6, 4, 11 and 17 isolates were determined as resistant to 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 and 1 antibiotics, respectively. Thirty-six isolates were found as sensitive to all antibiotics. Nine S.aureus isolates were found as vancomycin resistant. Among these isolates, the MIC of vancomycin for 2 isolates were 64 μg/ml and for 7 isolates MIC values were 32 μg/ml. Two and 3 of the isolates carried vanA and vanR genes, respectively. Four of the isolates did not carry any investigated van genes. The phylogenetic relations of the vancomycin resistant isolates were calculated as 51-75% and showed 9 unique genotypes. Forty-eight of the isolates showed polymorphism in coa gene and had 9 different coa profiles. All the investigated isolates carried spa gene and showed 4 different profiles. Conclusion: In a study, determining the vancomycine resistant isolates from mastitis isolates of staphylococci were showed that the milks and milk products which carry vancomycine resistant staphylococci possess a risk for public health.en_US
dc.formatV, 38 yaprak. : şekil ; 30 sm.en_US
dc.identifier.endpage47
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=q3-d9QtLoVA2OMExHSkJpZVv-tBewjH6qOJtxfWdX4lDAJPBJCNZ6dzzJoJpvPPC
dc.identifier.urihttp://libra.omu.edu.tr/tezler/116575.pdf
dc.identifier.yoktezid468768
dc.language.isotren_US
dc.language.isotr
dc.publisherOndokuz Mayıs Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsüen_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US]
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectVeteriner Hekimliği
dc.subjectFenotip
dc.subjectGenotip
dc.subjectMastit
dc.subjectMeme Hastalıkları
dc.subjectPolimeraz Zincirleme Reaksiyonu
dc.subjectStaphylococcus
dc.subjectVankomisin
dc.subjectVirülans
dc.subjectİlaçlara Direnç
dc.subjectVeterinary Medicineen_US
dc.subjectİlaçlara Direnç-Mikrobiyal
dc.subjectPhenotypeen_US
dc.subjectGenotypeen_US
dc.subjectMastitisen_US
dc.subjectBreast Diseasesen_US
dc.subjectPolymerase Chain Reactionen_US
dc.subjectStaphylococcusen_US
dc.subjectVancomycinen_US
dc.subjectVirulenceen_US
dc.subjectDrug Resistanceen_US
dc.subjectDrug Resistance-Microbialen_US
dc.subject.otherTEZ YÜK LİS G616m 2017en_US
dc.titleMastitis İzolatı Stafilokok Suşlarında Vankomisin Dirençliliğinin Fenotipik ve Genotipik Olarak Araştırılması
dc.titleThe Phenotypic and Genotypic Investigation of Vancomycine Resistance Among Mastitis Isolates of Staphylococcien_US
dc.typeMaster Thesisen_US
dspace.entity.typePublication

Files