Yeni Bir Schiff Bazı Molekülüne İn Siliko Tıbbi ve Hesaplamalı Yöntemlerle Bir Bakış

Abstract

Bu çalışmada yeni bir Schiff bazı molekülünün, (E)-1-(5-nitro-2-(piperidin-1-yl) phenyl)-N-(4-phenoxyphenyl) methanimine, sentezi ve karakterizasyonu amaçlandı. Bunun yanı sıra bu molekülün moleküler yüzey alanı, kristal yapısı, moleküler arası kuvvetleri, elektronik ve spektroskopik özellikleri araştırıldı. Ayrıca SARS-CoV-2 ana proteazının (Mpro) aktif yerleri üzerinde kenetleme deneyleri gerçekleştirildi ve sonuç yerli ligand N3 inhibitörünün etkinliği ile kıyaslandı. Başlık molekülü için ana bulgular aşağıdaki gibi özetlenebilir: Uzay grubu P-1’dir ve triklinik sistemde kristallenir. Birim hücre iki monomerik birimden oluşur. Molekülde güçlü elektrofilik saldırı pozisyonları vardır ama nükleofilik merkezler düşük etkinliktedir. FMO analizine göre, başlık bileşiği yumuşak, kinetik ve kimyasal olarak kararsız ve oldukça reaktif bir malzemedir. Moleküler kenetleme deneylerine göre, bağlanma serbest enerjisinin hesaplanan değeri (-9.28 kcal/mol) yerli inhibitörün değerinden (-7.11 kcal/mol) daha düşüktür ve bu yüzden başlık bileşiği SARS-CoV-2 ana proteazı için potansiyel bir inhibitör adayı olarak düşünülebilir.