Publication:
İn Vitro Enflamasyon Modelinde Hiperpolarizasyon ile Aktive Olan Siklik Nükleotid Kapılı (HCN) Kanalların Moleküler Düzeyde Araştırılması

dc.contributor.advisorAvcı, Bahattin
dc.contributor.authorÜrkmez, Yeşim Civil
dc.date.accessioned2025-12-13T08:51:13Z
dc.date.issued2022
dc.departmentTıp Fakültesi / Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı / Tıbbi Biyokimya Bilim Dalı
dc.description.abstractAmaç: Çalışmamızda nöroenflamasyon ve nörodejenerasyonda ekspresyonlarının değiştiği bilinen hiperpolarizasyonla aktive olan siklik nükleotid-kapılı (HCN) kanalların oluşturduğumuz enflamasyon modelinde makrofaj ile endotel hücre hatlarındaki ekspresyon düzeylerinin incelenmesi amaçlandı. Yöntem: Çalışmamızda HUVEC ve RAW hücre hatları kullanıldı. Hücrelere 1µg/ml Lipopolisakkarit (LPS) uygulandı. Altı saat sonra hücre vasatları alındı. TNF-α, IL-1, IL-2, IL-4, IL-10 konsantrasyonları ELISA yöntemiyle ölçüldü. LPS uygulaması sonrası hücre vasatları 24 saat boyunca hücrelere çapraz olarak uygulandı. HCN1/HCN2 protein düzeyleri Western-Blot yöntemiyle belirlendi. HCN-1/HCN-2 gen ekspresyonları RT-qPCR yöntemiyle belirlendi. Bulgular: Enflamasyon modelinde RAW hücre vasatında kontrole kıyasla TNF-α, IL-1 ve IL-2 seviyelerinde anlamlı artış gözlendi. IL-4 seviyesinde anlamlı fark görülmezken, IL-10 seviyesinde anlamlı azalma olduğu gözlendi. HUVEC hücre vasatında TNF-α düzeyinde anlamlı artış gözlenirken, diğer sitokinlerde fark gözlenmedi. Enflamasyon modelimizde HUVEC hücrelerinde HCN1 gen ekspresyonunda kontrol grubuna göre 8,44 kat anlamlı artış gözlendi. HCN2 gen ekspresyonunda anlamlı değişim gözlenmedi. RAW hücrelerinde HCN1 gen ekspresyonunda kontrole göre 6,71 kat anlamlı artış gözlendi. HCN2 ekspresyonundaki değişim istatistiksel olarak anlamlı değildi. Western-Blot analizinde HUVEC hücrelerinde LPS grubunda kontrole göre HCN1 düzeyinde istatistiksel olarak anlamlı artış gözlenirken; HCN2 düzeyinde anlamlı artış gözlenmedi. RAW hücrelerinde LPS grubunda kontrole göre HCN1 düzeyinde istatistiksel olarak anlamlı artış gözlenirken; HCN2 düzeyinde anlamlı artış gözlenmedi. İmmunfloresan incelemede HUVEC ve RAW hücrelerinde HCN1 ve HCN2 proteinlerinin hücre membranındaki ekspresyonunun LPS grubunda kontrol grubuna göre arttığı gözlendi. Tartışma ve Sonuç: Enflamasyon modelinde RAW ve HUVEC hücrelerinde HCN1 gen/protein ekspresyonları artarken, HCN2 gen/protein ekspresyonlarında anlamlı değişiklik gözlenmedi. Elde ettiğimiz veriler endotel ve makrofajlarda HCN1 alt tipinin hakim olduğunu ve enflamasyonda kritik rol oynayabileceğini düşündürmektedir.
dc.description.abstractAim: In our study, we aimed to create an inflammation model in endothelial and macrophage cell lines and to examine the changes in the expression of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated (HCN) channels at the molecular level. Material and Method: HUVEC and RAW cell lines were used in our study. 1µg/m LPS was applied to the cells. Cell media were taken six hours later. TNF-α, IL-1, IL-2, IL-4, IL-10 concentrations were measured by ELISA method. Cell media were cross-applied to cells for 24 hours after LPS. HCN1/HCN2 protein levels were determined by Western-Blot method. HCN-1/HCN-2 gene expressions were determined by RT-qPCR method. Results: In the inflammation model, a significant increase in TNF-α, IL-1 and IL-2 levels was observed in RAW cell media compared to the control. While no significant difference was observed in IL-4 level, a significant decrease was observed in IL-10 level. While a significant increase in TNF-α level was observed in HUVEC cell medium, no difference was observed in other cytokines. In our inflammation model, an 8,44 fold increase in HCN1 gene expression was observed in HUVEC cells compared to the control group. No significant change was observed in HCN2 gene expression. 6,71 fold increase in HCN1 gene expression was observed in RAW cells compared to the control. The change in HCN2 expression was not statistically significant. In the Western-Blot analysis, a statistically significant increase in HCN1 level was observed in the LPS group in HUVEC cells compared to the control; no significant increase in HCN2 level was observed. While a statistically significant increase in HCN1 level was observed in the LPS group in RAW cells compared to the control; no significant increase in HCN2 level was observed. In immunofluorescence examination, it was observed that the expression of HCN1 and HCN2 proteins in the cell membrane of HUVEC and RAW cells increased in the LPS group compared to the control group. Discussion and Conclusion: While HCN1 gene/protein expressions were increased in RAW and HUVEC cells in the inflammation model, no significant change was observed in HCN2 gene/protein expressions. Our data suggest that the HCN1 subtype is dominant in endothelium and macrophages and may play a critical role in inflammation.en_US
dc.identifier.endpage100
dc.identifier.urihttps://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=RsTBl6RWK25OBMIKtIgYYWZWJUmw4YD_rvN3nM0zQq6fQzlbs7Lswhr3sxxkIIOO
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12712/48694
dc.identifier.yoktezid756133
dc.language.isotr
dc.subjectBiyokimya
dc.subjectEndotelyum-Vasküler
dc.subjectEnzime Bağlı İmmünosorbent Testi
dc.subjectGen İfadesi
dc.subjectLipopolisakkaritler
dc.subjectMakrofajlar
dc.subjectPolarizasyon
dc.subjectPolimeraz Zincirleme Reaksiyonu
dc.subjectTümör Nekroz Faktörü-Alfa
dc.subjectİnflamasyon
dc.subjectİnterlökinler
dc.subjectBiochemistryen_US
dc.subjectEndothelium-Vascularen_US
dc.subjectEnzyme-Linked Immunosorbent Assayen_US
dc.subjectGene Expressionen_US
dc.subjectLipopolysaccharidesen_US
dc.subjectMacrophagesen_US
dc.subjectPolarizationen_US
dc.subjectPolymerase Chain Reactionen_US
dc.subjectTumor Necrosis Factor-Alphaen_US
dc.subjectInflammationen_US
dc.subjectInterleukinsen_US
dc.titleİn Vitro Enflamasyon Modelinde Hiperpolarizasyon ile Aktive Olan Siklik Nükleotid Kapılı (HCN) Kanalların Moleküler Düzeyde Araştırılması
dc.titleInvestigation of Hyperpolarization-Activated Cyclic Nucleotid-Gated (HCN) Channels in Vitro Inflammation Model at Molecular Levelen_US
dc.typeSpecialist Thesisen_US
dspace.entity.typePublication

Files