Bazı çıplak boyunlu köy tavuğu kongenik populasyonlarında mikrosatelit DNA polimorfizmi

Abstract

Bu çalışmada Samsun, Ordu ve Amasya'da çıplak boyunlu köy tavuklarının bulunduğu tespit edilen köylerdeki tavuklardan oluşturulan 7 kongenik populasyon ile referans olarak kullanılan bir Gerze tavuk populasyonunun 28 mikrosatelit lokusunda allelik polimorfizm durumlarının ve genetik ilişkilerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışılan 28 lokusta elde edilen allel sayısı 2-15 arasında değişmektedir. En az allel LEI0192 lokusunda, en çok allel ise LEI0234 lokusunda tespit edilmiştir. Bu lokuslar aynı zamanda polimorfizm bilgi içeriği (PIC) değeri sırasıyla en düşük (0,375) ve en yüksek (0,918) olan lokuslardır. Populasyonlar arasında genetik benzerlik katsayısı 0,000-0,177 arasında değişmektedir. Tüm lokuslar bakımından allel sayısı en az olan populasyon 32 allel ile SVNN, en çok olan ise 38 allel içeren ASNN02 ve SANN02'dir. Kümeleme analizleri sonucunda oluşturulan dendogramda bölgelere Filogenetik ağaç topolojisinde Samsun ve Amasya populasyonları ile Gerze populasyonu aynı grupta yer almış, Ordu populasyonları ise ayrı bir grup oluşturmuştur. Bulgular, populasyonların moleküler olarak göstermektedir.

In this study, we aimed to determine of allelic polymorphisms and genetic relationships among 7 populations generated from congenic village naked neck chicken in Samsun, Ordu and Amasya with Gerze chicken population used as a reference, by 28 microsatellite loci. The number of alleles obtained from all loci was 2 to15. Minimum and maximum number of alleles was determined in LEI0196 and LEI0234 microsatellite loci, respectively. Besides, these loci have the lowest (0.375) and the highest (0.918) polymorphism information content (PIC) values. Genetic similarity coefficients ranged from 0.000 to 0.177 among all populations. In terms of all loci, the least number of alleles was seen in SVNN population with 32 alleles and the most number of alleles were seen in ASNN02 and SANN02 populations with 38 alleles. Clustering analysis based phylogenetic dendrogram showed that the populations were mainly grouped according to their regions. Samsun, Amasya and Gerze populations were took place in the same group, while Ordu populations were in a separated group in the phylogenetic tree topology. The findings suggest that populations have had unique genetic richness at the molecular level.