Selective isolation and numerical classification of novel thermophilic streptomycetes

Abstract

Farklı habitatlardan izole edilen 45 termofilik streptomycetes, 8 termofilik tip örneği, 29 referans ve bunlardan rastgele seçilmiş 16 duplike suş, 163 birim fenotipik karakter yönünden test edildi. Verilerin analizi simple matching coefficients (SSM), kümelendirme işlemi de complete algorithm kullanılarak gerçekleştirildi. Yüksek cophenetic korelasyon ve düşük test hatası değerleri ile yüksek benzerlik seviyesi kabül edilen nümerik taxonomik kriterler ile uyum içerisinde olduğu açıkça görüldü. Test suşları yedi büyük (5-8 suş), dokuz küçük (2-4 suş) ve on tek üyeli kümeleri içeren dört agregat grup olarak belirlendi. Buradan, numerik taksonomik çalışmaların, biyoteknolojik önemi olan termofilik streptomycetes'lerin doğal habitatlarındaki çeşitliliği hakkında önemli bilgiler verdiği sonucuna varılmaktadır.

: Forty-five thermophilic streptomycetes were isolated from different habitats and examined for 163 unit characters with 8 representative thermophilic type strains, 29 reference strains and 16 randomly selected duplicated organisms for many phenotypic properties. The data were evaluated using the simple matching coefficients (S_SM), and clustering achieved using the complete algorithm. It was clearly seen that the high cophenetic correlation, low test error values and high similarity level agreed with the defined numerical taxonomic criteria. The test strains were assigned to four aggregate groups consisting seven major (5-8 strains), nine minor (2-4 strains) and ten single membered clusters. It can be concluded that the numerical taxonomic studies yielded valuable information on the biodiversity of biotechnologically significant thermophilic streptomycetes from natural habitats.