Gentamisin, seftriakson, siprofloksasin ve meropenem'in klebsiella pneumoniae izolatlarına karşı antibiyofilm aktivitelerinin araştırılması
Künye
Nalbant, G. (2021). Gentamisin, seftriakson, siprofloksasin ve meropenem'in klebsiella pneumoniae izolatlarına karşı antibiyofilm aktivitelerinin araştırılması. (Yüksek lisans tezi). Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Samsun.Özet
Klebsiella pneumoniae, hastane ve toplum kaynaklı enfeksiyonlara neden
olabilen fırsatçı patojen bir bakteridir. K. pneumoniae’nın da önemli virülas
faktörlerinden biri olan biyofilm, mikrobiyal türlerin kendilerini çevresel etkenlerden
korunmak ve yaşamsal faaliyetleri için elverişli bir ortam sağlamak amacıyla
oluşturdukları bir mikro-ekosistemdir. Çalışmamızda idrar örneklerinden izole edilen
K. pneumoniae izolatlarının biyofilm oluşturma yeteneği ve gentamisin, meropenem,
seftriakson ve siprofloksasin’in antibiyofilm aktivitesi araştırılması amaçlanmıştır.
Çalışmaya çeşitli servislerden gönderilen idrar örneklerinden izole edilen 181 K.
pneumoniae izolatı dahil edildi. İzolatlar konvansyonel ve otomatize sistemler
kullanılarak tanımlandı. Çalışmaya dahil edilen izolatların biyofilm oluşturma
yetenekleri mikrotitrasyon plak yöntemi ile çalışıldı ve sonuçlar standart suşlarının
absorbans değerleri ile karşılaştırılarak kantitatif olarak skorlandı. Biyofilm
oluşturduğu tespit edilen izolatların gentamisin, meropenem, seftriakson ve
siprofloksasin için antibiyotik duyarlılık durumları mikrodilüsyon yöntemi
kullanılarak çalışıldı. Bu sonuçlara göre orta derece biyofilm oluşturduğu tespit edilen
izolatlar içinden dört antibiyotiğe de duyarlı olan 7 izolatın, tüm antibiyotikler için ayrı
ayrı antibiyofilm aktivitesi araştırıldı. Antibiyofilm aktivitesi gösteren antibiyotik ve
konsantrasyonlarından seçilen örneklerdeki biyofilm oluşumları elektron mikroskobu
kullanılarak görüntülendi.
Çalışmaya dahil edilen 181 izolatın 90 (%49.7)’ında biyofilm oluşumu
gözlenmiştir. Bunlardan 27 (%30)’si orta derece 63 (%70)’üde zayıf derecede biyofilm
oluşturmuştur. Orta derece biyofilm oluşturanların meropeneme duyarlı olma durumu,
zayıf derecede biyofilm oluşturanlara göre istatistiksel olarak anlamlı olduğu
görülürken, diğer antibiyotiklerde böyle bir sonuç saptanmamıştır. Biyofilm önlenim
çalışılan izolatlarda gentamisin, meropenem, seftriakson ve siprofloksasin için bazı
izolatlarda çeşitli konsantrasyonlarda antibiyofilm aktivitesi saptanmıştır.
Çalışmamız sonunda antibiyotiklerin biyofilm oluşumlarının giderilmesinde
kullanılabileceği düşünülmektedir. Bununla birlikte hangi antibiyotiklerin hangi
dozlarda kullanılacağının tespit edilebilmesi için farklı yöntemlerin de kullanıldığı,
geniş kapsamlı yeni çalışmalara ihtiyaç olduğu görülmüştür. Klebsiella pneumoniae is an opportunistic pathogenic bacterium that can cause
hospital and community-acquired infections. Biofilm, one of the important virulence
factors of K. pneumoniae, is a micro-ecosystem created by microbial species to protect
themselves from environmental factors and to provide a suitable environment for their
vital activities. In our study, it was aimed to investigate the biofilm formation ability
of K. pneumoniae isolates isolated from urine samples and the antibiotic activity of
gentamicin, meropenem, ceftriaxone and ciprofloxacin.
The study included 181 isolates of K. pneumoniae isolated from urine samples
sent from various services. Isolates were identified using conventional and automated
systems. According to these results, the antibiotic activity of 7 isolates that were
susceptible to four antibiotics, among the isolates that showed moderate biofilm
formation, was investigated separately for all antibiotics. Biofilm formations in
samples selected from antibiotics and concentrations showing antibiofilm activity
were viewed using electron microscopy.
Biofilm formation was observed in 90 (49.7%) of the 181 isolates included in
the study. Of these, 27 (30%) formed medium degree and 63 (70%) weak biofilm.
While it was observed that susceptibility to meropenem in moderate biofilm forming
was statistically significant compared to those forming a weak biofilm, this result was
not found with other antibiotics. Various concentrations of antibiofilm activity were
detected in some isolates for gentamicin, meropenem, ceftriaxone and ciprofloxacin in
isolates with biofilm inhibition.
As a result of our study, it is thought that antibiotics can be used in removing
biofilm formation. However, it has been observed that different methods are used to
determine which antibiotics and in what doses to use and new complex studies are
needed