Orta Karadeniz bölgesinde bazı illerde yetiştirilen bakla, fasulye ve bezelye bitkilerinin rhizobiyal simbiyontlarının genetik çeşitliliği / Cem Tolga Gürkanlı ; danışman İbrahim Özkoç

Abstract

Özet,Bu çalısmada Samsun, Sinop, Ordu ve Amasya illerinde yetistirilen bakla (V.faba L.), bezelye (P. sativum L.) ve fasulye (P. vulgaris L.) bitkilerinin kök nodüllerinden izole edilen Rhizobia grubu bakterilerin teshisi ve bu izolatlarıniçerdikleri nodülasyon ve azot fiksasyon genlerinin belirlenmesi amaçlanmıstır.Bu amaçla belirtilen illerden, farklı ilçeleri temsil edecek sekilde 30 bakla, 30bezelye ve 30 fasulye olmak üzere toplam 90 Rhizobia izolatı elde edilmistir. Dzolatların ön gruplamaları 16S rDNA PZR-RFLP analizi ile yapıldıktan sonra, temsilci izolatların16S rDNA, recA, nodA ve nifH baz dizileri belirlenmis ve filogenetik analizleri yapılmıstır.16S rDNA ve recA filogenileri sonucunda, bakla ve bezelye’den elde edilenizolatların tümü R. leguminosarum bv. viciae ile iliskili bulunurken, fasulye’den izole edilen izolatlar R. leguminosarum bv. phaseoli, R. etli bv. phaseoli, R. phaseoli türleriile iliskili olarak bulunmustur. Ayrıca analizlerde bu kromozomal genlerin farklı Rhizobiyal türler arasında lateral olarak transfer edildiğine dair kanıtlar da eldeedilmistir. Bu tez Türkiye de Rhizobia grubu bakterilerin moleküler olarak teshisine yönelik ilk çalısma olması nedeniyle bu türlerin de Türkiye’den ilk kayıtlarınıbarındırmaktadır.NodA ve nifH baz dizileri kullanılarak yapılan filogenetik analizlerde fasulye’den elde edilen R. leguminosarum izolatları ve yine bu bölgede bulunan fakatorijinal olarak Güney Amerika kökenli olan R. etli veya R. phaseoli izolatları arasında simbiyotik plazmitlerin (pSym) lateral olarak transfer edildiğine dair güçlü veriler eldeedilmistir.Ayrıca bu çalısmada, daha önceki çalısmalarda nodülasyon testleri ile ileri sürülen, bakla ve belirli Rlv popülasyonları arasındaki özgünlüğe dair ilk molekülerkanıtlar da bulunmustur.