Karakaya koyun populasyonlarında genetik varyasyonun kapd yöntemiyle analizi / Levent Mercan; Danışman Ahmet Okumuş.
Abstract
Bu çalışmada 5 Karayaka koyunu genotipinde genetik benzerliğin değerlendirilmesi ve bölgedeki Karayaka koyun populasyonlarına ait mevcut genetik varyasyonun ortaya konulması amaçlanmıştır. Çalışmanın materyalini oluşturan populasyonlar, örneklerin alındığı 3 bölge ile ilgili olarak Bafra I, Bafra II, Ladik I, Ladik II ve Kampus isimleriyle kodlanmıştır. Çalışmada Rasgele Çoğaltılmış Polimorfik DNA (RAPD) metodu uygulanmış ve OP-AI ile OP-D serisi 10 mer'lik 40 RAPD primer kullanılmıştır. Kan örneklerinden DNA'nın özütlenmesi için fenol-kloroform yöntemi kullanılmış, DNA çoğaltımı ise Hybaid PCR Express cihazında yapılmıştır Çoğaltılmış DNA fragmentleri %1,5'lik agaroz jelde ayrımlanmış ve ethidium bromide ile boyanmıştır. Bantlar UV transmilunatör kullanılarak görünür hale getirilmiştir. Bantların varlığında "1", yokluğunda "0" olacak şekilde veri matriksi hazırlanmış ve bu matriks kullanılarak benzerlik matriksleri hesaplanmıştır. Her populasyona ait toplam bant sayıları X2 istatistiki testi ile karşılaştırılmıştır. Çalışma sonucunda en fazla bant sayısı Bafra II populasyonunda (24) ve en düşük bant sayısı Ladik I (14) populasyonunda gözlenmiştir. Populasyonlara ait genetik benzerlik oranları 0,25 ile 0,6677 arasında varyasyon göstermiştir. Ladik I ve Ladik II populasyonları % 66,67 oranıyla birbirlerine en fazla benzeyen populasyonlar olarak ortaya çıkmıştır. En düşük benzerlik katsayısının ise % 25 ile Kampus ve Ladik II populasyonları arasında olduğu belirlenmiştir. Sonuçlar, dendogram şeklinde ifade edilmiştir.
